仪征市人民医院
仪征市人民医院始建于1914年，是一所集医疗、教学、科研为一体的国家二级甲等综合性医院，国家级爱婴医院，仪征市红十字医院，扬州大学医学院附属医院，南京医科大学教学医院，2010年挂牌成立了“南京大学仪征肿瘤精确放疗研究中心”，成为江苏省人民医院“技术支持医院”。2011年1月，仪征市政府将中核华兴医院划归该院，成为仪征市人民医院西区医院。医院先后荣获县级综合医院“全国院务公开示范点”、江苏省文明单位、江苏省医疗机构诚信服务执业单位，江苏省公共机构节能环保示范单位、江苏省青年文明志愿者服务基地等荣誉称号。
苏北人民医院
江苏省苏北人民医院又名扬州大学附属苏北人民医院、南京医科大学扬州临床医学院。医院前身是美国浸礼会1900年创办的扬州浸会医院，1994年被原卫生部评定为江苏省首批三级甲等综合性医院，先后获得全国文明单位、全国卫生系统先进集体、全国改革创新医院、全国改善医疗服务示范医院、全国医保管理先进集体、全国巾帼建功先进集体、全国医院后勤管理创新先进单位、江苏省十佳医院等荣誉称号。
扬州大学附属医院
扬州大学附属医院（扬州市第一人民医院），是一所集医疗、教学、科研、急救、预防、康复为一体的综合性三级甲等医院。医院设有扬州大学内科学、外科学、影像医学及核医学三个硕士点。2008年被确定为首批江苏省住院医师规范化培训基地，获得国家药物临床试验机构资格认定证书，9个专业具备药物临床试验资格。医院先后被评为“全国精神文明建设工作先进单位”、“全国文明单位”。
仪征市中医院
仪征市中医院成立于1986年，是一所集医疗、预防、保健为一体的综合性二级甲等中医医院，南京中医药大学、扬州大学医学院教学医院；南京都市圈中医院合作发展联合体成员，江苏省中医院协作医院。医院占地面积1.35万平方米，建筑面积1.75万平方米，开放床位300张，设8个病区。在职员工330人，其中副高职称以上人员46名，中级职称人员90名，硕士12名。有全国第四、五批老中医药专家继承指导老师1名，省名中医2名。
高邮市第二人民医院
高邮市第二人民医院创立于1957年9月，系市直属医疗卫生单位，具有显著专科特色的非营利性综合性医院，承担全市皮肤病、性病、艾滋病和精神病的预防控制、医疗和业务指导，并开展相关疾病的研究与技术指导，人员技术培训和健康教育工作。曾获得卫生部、省及卫生厅和扬州市多种先进集体及个人荣誉称号；是扬州市和高邮市文明单位，规范收费医院、平安医院。
扬州市中医院
扬州市中医院创建于1978年，是一所中医特色显著、西医功能全面、技术力量雄厚、设备设施先进的现代综合性“国家三级甲等中医医院”，是扬州市定点涉外医院，也是南京中医药大学附属医院和扬州大学、南通大学的教学医院。2005年1月通过了ISO9001：2000国际质量管理体系认证，并取得了国家注册认证证书。
高邮市中医院
高邮市中医医院是一所集中医医疗、预防、教学、科研、急救、康复为一体的国家三级乙等中医医院，系南京中医药大学、安徽中医药大学教学医院、江苏省首批中医“治未病”健康工程试点单位。医院先后被授予江苏省“价格诚信单位”、扬州市“规范收费医院、扬州市卫生系统“三好一满意”、“白求恩杯”竞赛、中医医院管理年活动先进单位、高邮市文明单位等称号。
扬州市广陵区曲江街道社区卫生服务中心
曲江街道社区卫生服务中心是在城东医院基础上通过工作职能转换，在广陵区卫生局和曲江街办的领导和指导下，严格按照市卫生局下发的社区卫生服务机构设置标准构建而成的。曲江街道覆盖区域18.6平方公里，共有13个社区居委会，居民总户数42266户，60岁以上人口13336人，总人口12.06万人。中心下辖6个社区总户数13334户，总人口5.6万人，60岁以上人口4262人。中心占地3600多平方米，医疗业务用房面积4475多平方米。全中心工作人员共有74人，其中卫技人员67人，中级职称29人，初级职称38人。中心
江苏省宝应县人民医院
宝应县人民医院成立于1949年8月，是全县最大的综合性医院和医疗、救护、教学及科研中心，承担着全县及周边地区百万人口的医疗救护任务，现为扬州大学、江苏大学教学医院，曾荣获“全国卫生系统先进集体”称号。
扬州市江都人民医院
扬州市江都人民医院是全区最大的综合性医院，始建于1950年，前身是建国前设立的渡江支前总队部门诊室和江都县人民政府门诊室。经过几代人的艰苦努力，现已发展成为一所环境优美、设施先进、科室齐全、技术力量雄厚，集医疗、教学、科研、预防、保健、急救于一体的三级综合医院和国家级“爱婴医院”。是扬州大学医学院附属医院以及东南大学医学院、江苏大学医学院的教学医院，也是扬州城区医疗保险、江都区新型农村合作医疗定点单位。
武警江苏总队医院
武警江苏省总队医院建院于1952年，原系解放军第120医院，武警部队三级甲等医院。为武警后勤学院、山西医科大学、扬州大学医学院教学医院，南京医科大学实习基地。开设床位600张，设有武警部队超声影像中心、矫形外科中心、肝病诊疗中心、超声医疗国家工程研究中心科研合作基地、第二军医大学骨科研究所分所、中国癌症基金会武警分会扬州肿瘤防治中心、美国枢法模·丹历（脊柱外科）中国培训中心、中德关节外科合作中心、江苏省红十字会应急医疗救援大队。
扬州市第二人民医院
扬州市第二人民医院始建于1972年，是一所大专科小综合的二级甲等专科医院。2004年12月在市委、市政府及市卫生局的关心下，经过医疗资源整合，在原先综合医疗的基础上,增加了惠民医疗服务，增挂“扬州市惠民医院”牌子，担负着全市一万多名低保特困群体和低保边缘人群的医疗救助工作。